Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BARX2Q9UMQ3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms