Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALD1Q9ULE6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PALD1Q9ULE6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PALD1Q9ULE6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PALD1Q9ULE6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PALD1Q9ULE6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PALD1Q9ULE6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PALD1Q9ULE6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PALD1Q9ULE6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PALD1Q9ULE6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PALD1Q9ULE6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PALD1Q9ULE6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PALD1Q9ULE6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PALD1Q9ULE6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms