Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DENND2AQ9ULE3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms