Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSKSQ9UJT2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms