Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MBD1Q9UIS9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms