Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CPA4Q9UI42 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPA4Q9UI42 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms