Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPC1L1Q9UHC9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NPC1L1Q9UHC9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms