Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SRP68Q9UHB9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRP68Q9UHB9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRP68Q9UHB9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRP68Q9UHB9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRP68Q9UHB9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRP68Q9UHB9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SRP68Q9UHB9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SRP68Q9UHB9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRP68Q9UHB9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRP68Q9UHB9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms