Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA9Q9UGM1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA9Q9UGM1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms