Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRP2BPQ9P2M1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LRP2BPQ9P2M1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms