Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
CCDC180Q9P1Z9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC41.26■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC41.25■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC41.24■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC41.22■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC41.2■■■■■ 4.19
CCDC180Q9P1Z9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC41.16■■■■■ 4.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms