Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCHIP1Q9P0W5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms