Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HMG20BQ9P0W2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMG20BQ9P0W2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms