Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
C9orf78Q9NZ63 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf78Q9NZ63 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms