Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A4Q9NY91 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A4Q9NY91 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms