Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCM9Q9NXL9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCM9Q9NXL9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCM9Q9NXL9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCM9Q9NXL9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCM9Q9NXL9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MCM9Q9NXL9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCM9Q9NXL9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCM9Q9NXL9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCM9Q9NXL9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCM9Q9NXL9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MCM9Q9NXL9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCM9Q9NXL9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCM9Q9NXL9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCM9Q9NXL9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCM9Q9NXL9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCM9Q9NXL9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCM9Q9NXL9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCM9Q9NXL9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCM9Q9NXL9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCM9Q9NXL9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCM9Q9NXL9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MCM9Q9NXL9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCM9Q9NXL9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCM9Q9NXL9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCM9Q9NXL9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCM9Q9NXL9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms