Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TOR4AQ9NXH8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TOR4AQ9NXH8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms