Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC4BQ9NT99 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC4BQ9NT99 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms