Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMILIN3Q9NT22 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EMILIN3Q9NT22 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EMILIN3Q9NT22 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EMILIN3Q9NT22 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EMILIN3Q9NT22 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EMILIN3Q9NT22 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EMILIN3Q9NT22 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EMILIN3Q9NT22 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EMILIN3Q9NT22 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EMILIN3Q9NT22 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EMILIN3Q9NT22 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMILIN3Q9NT22 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMILIN3Q9NT22 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMILIN3Q9NT22 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMILIN3Q9NT22 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMILIN3Q9NT22 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMILIN3Q9NT22 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMILIN3Q9NT22 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMILIN3Q9NT22 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMILIN3Q9NT22 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMILIN3Q9NT22 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMILIN3Q9NT22 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMILIN3Q9NT22 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMILIN3Q9NT22 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMILIN3Q9NT22 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMILIN3Q9NT22 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMILIN3Q9NT22 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMILIN3Q9NT22 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms