Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPMQ9NSP4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPMQ9NSP4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms