Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOMER2Q9NSB8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOMER2Q9NSB8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOMER2Q9NSB8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOMER2Q9NSB8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOMER2Q9NSB8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOMER2Q9NSB8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOMER2Q9NSB8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOMER2Q9NSB8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOMER2Q9NSB8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOMER2Q9NSB8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOMER2Q9NSB8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOMER2Q9NSB8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOMER2Q9NSB8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOMER2Q9NSB8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOMER2Q9NSB8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOMER2Q9NSB8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOMER2Q9NSB8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOMER2Q9NSB8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOMER2Q9NSB8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOMER2Q9NSB8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms