Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TM7SF3Q9NS93 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TM7SF3Q9NS93 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms