Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAPOLBQ9NRJ5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms