Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms