Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NRIP3Q9NQ35 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRIP3Q9NQ35 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms