Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SEMA4BQ9NPR2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms