Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARFGAP3Q9NP61 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms