Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UPF2Q9HAU5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPF2Q9HAU5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms