Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FNDC4Q9H6D8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms