Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCL3Q9H2J4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms