Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHARPINQ9H0F6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHARPINQ9H0F6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms