Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZC3H12CQ9C0D7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZC3H12CQ9C0D7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZC3H12CQ9C0D7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZC3H12CQ9C0D7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZC3H12CQ9C0D7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZC3H12CQ9C0D7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms