Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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FOXQ1Q9C009 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXQ1Q9C009 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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FOXQ1Q9C009 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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FOXQ1Q9C009 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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FOXQ1Q9C009 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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FOXQ1Q9C009 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXQ1Q9C009 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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