Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSPO3Q9BXY4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSPO3Q9BXY4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSPO3Q9BXY4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSPO3Q9BXY4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSPO3Q9BXY4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSPO3Q9BXY4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSPO3Q9BXY4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSPO3Q9BXY4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSPO3Q9BXY4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms