Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC34.36■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCD2Q9BXW9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FANCD2Q9BXW9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms