Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms