Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC94Q9BW85 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms