Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms