Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms