Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RIOK1Q9BRS2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIOK1Q9BRS2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms