Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EBF4Q9BQW3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms