Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms