Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MEIS3Q99687 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEIS3Q99687 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms