Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHP1Q99653 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms