Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF3CQ99613 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF3CQ99613 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms