Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PIK3R4Q99570 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PIK3R4Q99570 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms