Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSMD1Q99460 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD1Q99460 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms