Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R9BQ96SB3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R9BQ96SB3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R9BQ96SB3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R9BQ96SB3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R9BQ96SB3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R9BQ96SB3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R9BQ96SB3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R9BQ96SB3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R9BQ96SB3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R9BQ96SB3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R9BQ96SB3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R9BQ96SB3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R9BQ96SB3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R9BQ96SB3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R9BQ96SB3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R9BQ96SB3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R9BQ96SB3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms