Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT6

CTAGE1, cTAGE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE1Q96RT6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTAGE1Q96RT6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms