Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC38A2Q96QD8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms